大多数分析和小规模制备生物大分子首选是台式冷冻水平转子离心机，它能产生强大的离心力，生物大分子在水平转子的离心管中有较长的沉降路径，壁效应较小，可使生物大分子获得精确分离。

离心管尺寸和转速不同，分离效果不同。小剂量样品可用细长型离心管，大容量样品可用粗短型离心管，它们都可使样品区带尽可能窄。然而，为了提高分辨率一味增加生物大分子的沉降路径，会使离心时间延长。在此过程中，有些蛋白质会失去活性。随着沉降时间的延长引起的扩散，会导致区带变宽。

DD5M立式低速大容量离心机

立式大容量冷冻离心机分离生物大分子时转子的选择

立式大容量冷冻离心机分离生物大分子的沉降速度比较小，生物大分子通过介质达到等密度位置所需要的时间很长，因此要选择沉降路径短和离心力场强度大的高效能转子。

实践证明，选择小角度角转子和垂直转子符合大多数生物大分子的分离要求。在这些转子中梯度柱的底部和顶部距旋转轴的距离之差较小，生物大分子移动的有效路径短，容纳生物大分子的区带横截面大，因此梯度容量也大。

应尽量避免使用长水平转子，在其中生物大分子移动路径长，分离时间长，并且由于梯度横截面小会引起梯度过载，导致区带变形。

当然，不是说其它类型的转子就不能进行生物大分子的等密度分离。沉降系数大的生物大分子可以使用小角度角转子和垂直转子，也可以使用水平转子。区带转子由于分辨率高，在分离大量生物大分子样品中得到了普遍应用。